1、能量轉(zhuǎn)化效率高。燃料電池能量轉(zhuǎn)化過程不受卡諾循環(huán)的限制，理論上最大效率可達(dá)80%以上，實(shí)際工作效率受極化現(xiàn)象等影響在40%~60%。

2、清潔無污染。以純氫為燃料時(shí)，產(chǎn)物只有水，幾乎不產(chǎn)生有害物質(zhì)。富氫氣體為燃料進(jìn)行脫硫除氮工作，幾乎不排放硫氧化物和氮氧化物。

3、工作噪音低。運(yùn)動(dòng)部件非常少，因此其工作噪音很小，十分安靜。

4、部件少，可靠性及維護(hù)性好。可以作為各種不間斷電源和應(yīng)急電源使用。

（1）質(zhì)子交換膜燃料電池常溫運(yùn)行，啟動(dòng)/關(guān)閉迅速；

（2）質(zhì)子交換膜燃料電池比功率（kW/kg，或者kW/L）髙；

（3）質(zhì)子交換膜燃料電池的固體質(zhì)子交換膜對(duì)電池其它部件都無腐蝕作用；

（4）質(zhì)子交換膜燃料電池可制成集電池發(fā)電與水電解于一體的可逆再生式燃料電池系統(tǒng)（一種以氫作介質(zhì)的儲(chǔ)能系統(tǒng)）。

質(zhì)子交換膜燃料電池之所以沒有得到廣泛的應(yīng)用，主要是質(zhì)子交換膜燃料電池存在以下一些缺點(diǎn)仍然沒有很好的解決方案。

（1）質(zhì)子交換膜燃料電池是以鉑族貴金屬作電催化劑，這就導(dǎo)致質(zhì)子交換膜燃料電池成本高；

（2）質(zhì)子交換膜燃料電池的催化劑的催化活性對(duì)CO的毐害非常敏感，因而要求燃料凈化程度高;

（3）質(zhì)子交換膜燃料電池可回收余熱的溫度遠(yuǎn)低于其它類型燃料電池（堿性燃料電池除外），只能以熱水方式回收余熱；

（4）電質(zhì)子交換膜燃料電池性能受到質(zhì)子交換膜水含量與溫度的影響比較顯著，致使水熱管理系統(tǒng)復(fù)雜。